Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRDE2Q9H7Z3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms