Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D4AQ9H788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH2D4AQ9H788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms