Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR55Q9H6Y2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR55Q9H6Y2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms