Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH19Q9H159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH19Q9H159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms