Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A8Q9C0K1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A8Q9C0K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms