Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMBRA1Q9C0C7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.7 ms