Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM7Q9C029 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM7Q9C029 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms