Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFIH1Q9BYX4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFIH1Q9BYX4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms