Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL1Q9BYD6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL1Q9BYD6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL1Q9BYD6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms