Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSPO3Q9BXY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms