Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS4

TMEM59, Transmembrane protein 59, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59Q9BXS4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM59Q9BXS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM59Q9BXS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM59Q9BXS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms