Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA4Q9BXL8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms