Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF4Q9BXJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF4Q9BXJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF4Q9BXJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms