Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGPP1Q9BX95 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGPP1Q9BX95 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms