Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNM1Q9BWG6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNM1Q9BWG6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNM1Q9BWG6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNM1Q9BWG6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNM1Q9BWG6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNM1Q9BWG6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNM1Q9BWG6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms