Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRACR2AQ9BSW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRACR2AQ9BSW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms