Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf88Q9BSF0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms