Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPKQ9BS16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms