Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOXF2Q9BQY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms