Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL4Q9BPW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL4Q9BPW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms