Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AKAP9Q99996 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AKAP9Q99996 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AKAP9Q99996 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AKAP9Q99996 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AKAP9Q99996 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AKAP9Q99996 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AKAP9Q99996 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AKAP9Q99996 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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