Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIGMAR1Q99720 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms