Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MEIS3Q99687 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MEIS3Q99687 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MEIS3Q99687 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MEIS3Q99687 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MEIS3Q99687 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEIS3Q99687 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms