Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPS8Q99627 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms