Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP19Q99542 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP19Q99542 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms