Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGMNQ99538 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGMNQ99538 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms