Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERD3LQ96RJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FERD3LQ96RJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms