Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACCSQ96QU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACCSQ96QU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACCSQ96QU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms