Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAM1Q96QH2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRAM1Q96QH2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRAM1Q96QH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms