Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK15Q96Q40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms