Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMTK3Q96Q04 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMTK3Q96Q04 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMTK3Q96Q04 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms