Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A1Q96NT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A1Q96NT5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A1Q96NT5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms