Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00479Q96M42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00479Q96M42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms