Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPGRIP1Q96KN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPGRIP1Q96KN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms