Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PRAC1Q96KF2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms