Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A4AQ96JQ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A4AQ96JQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A4AQ96JQ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms