Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCORQ96JN0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCORQ96JN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms