Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VCPIP1Q96JH7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VCPIP1Q96JH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms