Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APIPQ96GX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms