Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VMP1Q96GC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VMP1Q96GC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMP1Q96GC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms