Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJA3Q96EY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJA3Q96EY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms