Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALSU1Q96EH3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MALSU1Q96EH3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms