Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC126Q96EE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms