Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EME1Q96AY2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms