Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLAMF9Q96A28 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLAMF9Q96A28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLAMF9Q96A28 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms