Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM54Q969K7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM54Q969K7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms