Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN3Q969G5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN3Q969G5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms