Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRN2Q92932 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2Q92932 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms