Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDAQ92838 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDAQ92838 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDAQ92838 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDAQ92838 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDAQ92838 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDAQ92838 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDAQ92838 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDAQ92838 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EDAQ92838 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDAQ92838 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDAQ92838 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDAQ92838 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDAQ92838 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDAQ92838 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDAQ92838 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDAQ92838 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDAQ92838 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDAQ92838 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDAQ92838 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDAQ92838 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDAQ92838 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDAQ92838 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDAQ92838 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDAQ92838 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDAQ92838 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDAQ92838 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDAQ92838 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDAQ92838 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDAQ92838 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDAQ92838 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDAQ92838 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDAQ92838 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDAQ92838 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDAQ92838 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDAQ92838 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDAQ92838 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDAQ92838 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDAQ92838 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EDAQ92838 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDAQ92838 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDAQ92838 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDAQ92838 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EDAQ92838 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDAQ92838 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDAQ92838 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDAQ92838 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EDAQ92838 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDAQ92838 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDAQ92838 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDAQ92838 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDAQ92838 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms