Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB1Q8WWH5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB1Q8WWH5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB1Q8WWH5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRUB1Q8WWH5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRUB1Q8WWH5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms